Деятельность различных структурных подразделений ГНЦ ПМБ направлена на достижение общих целей Центра: улучшение состояния здравоохранения в стране путём получения новых научных знаний, совершенствование средств и способов диагностики, профилактики и лечения особо опасных инфекций на основе современных достижений генетики, иммунологии, биотехнологии. Разработка и совершенствование технологии производства новых генно-инженерных и иммунобиологических препаратов.

Научно-исследовательские подразделения:

• Отдел особо опасных инфекций
  • Лаборатория микробиологии чумы
  • Лаборатория микробиологии сибирской язвы
  • Лаборатория микробиологии туляремии
• Лаборатория молекулярной биологии
• Лаборатория молекулярной диагностики и генно-инженерных препаратов
• Лаборатория нанобиотехнологии
• Лаборатория биологической безопасности
• Лаборатория биологических испытаний
• Отдел биологических технологий
• Питательные среды
• Отдел информационных технологий