Группа геномных исследований

Группа геномных исследований ФБУН ГНЦ ПМБ специализируется на изучении бактерий 1-4 групп патогенности, а также непатогенных микроорганизмов.

Подразделение ФБУН ГНЦ ПМБ, ответственное за осуществление деятельности ГКПМ-Оболенск
  • Отдел коллекционных культур ФБУН ГНЦ ПМБ
Руководитель группы геномный исследований
  • Старший научный сотрудник Кисличкина Ангелина Александровна
    Тел.: +7 (4967) 31-21-56

*Для проведения работ необходимо подать заявку на бланке организации-заявителя. Для ускорения переписки рассматриваются факсимильные и электронные копии документов. Заявки необходимо отправлять на факс: +7 (4967) 36-00-03 или электронный адрес: Адрес электронной почты защищен от спам-ботов. Для просмотра адреса в вашем браузере должен быть включен Javascript.. В заявке желательно указать контактные данные исполнителя.

Список и стоимость услуг, предоставляемых Группой геномных исследований ФБУН ГНЦ ПМБ (2024 г.)

НаименованиеЦена
1. Геномное секвенирование штаммов бактерий
Предварительная идентификация микроорганизма, выделение ДНК микроорганизма, приготовление библиотеки, секвенирование, биоинформационный анализ. При необходимости может быть проведена лиофилизация культуры микроорганизма, или подготовка к другому варианту длительного хранения.		 от 30 000 рублей за геном
2. Секвенирование 16S рРНК (16S метагеномика)
Выделение фракции ДНК из образца, амплификация гена 16S рРНК, подготовка библиотеки для секвенирования, секвенирование на платформе MiSeq, биоинформационный анализ.		 от 30 000 рублей за образец
3. Тотальное секвенирование ДНК образа сообщества микроорганизмов (Shot gun метагеномика, метагеномный анализ методом дробовика)
Выделение ДНК из образца, подготовка библиотеки для секвенирования, секвенирование на платформе MiSeq, биоинформационный анализ.		 по договорённости
4. Мономолекулярное нанопоровое секвенирование штаммов бактерий
Предварительная идентификация микроорганизма, выделение ДНК микроорганизма, приготовление библиотеки, секвенирование на системе MinION, биоинформационный анализ. При необходимости может быть проведена лиофилизация культуры микроорганизма, или подготовка к другому варианту длительного хранения. Секвенирование на системе MinION во многих случаях позволяет реконструировать полные последовательности бактериальных хромосом и плазмид. Однако частота возникновения ошибок при проведении подобных исследований значительно ниже, чем при проведении геномного секвенирования на оборудовании Illumina.		 от 50 000 за геном
5. Полногеномное секвенирование бактериальных штаммов с использованием технологии гибридного секвенирования
Гибридное секвенирование основывается на сочетании мономолекулярного нанопорового секвенирования (MinION) и секвенирования путем синтеза на оборудовании Illumina. Работа включает секвенирование генома с использованием обеих платформ, а также биоинформационных анализ данных. В подавляющем большинстве случаев удаётся реконструировать полные (кольцевые) последовательности бактериальных хромосом и плазмид. При этом подходе значительно снижается количество неправильно определенных оснований.		 от 100 000 рублей за геном
6. Биоинформационный анализ данных
Сборка геномов, анализ принадлежности к филогенетической группе, поиск маркеров устойчивости к антимикробным препаратам, а также другая работа, в том числе размещение данных на серверах NCBI и подготовка публикаций в журналы.		 по договорённости
KREMLIN.RU width=Сайт Президента Российской Федерации
GOVERNMENT.RUСайт Правительства Российской Федерации
ROSPOTREBNADZOR.RUСайт Роспотребнадзора Российской Федерации
OPEN.GOV.RUСайт Министерства здравоохраниения Российской Федерации
GOSUSLUGI.RUПортал Государственные услуги
YOUNGSCIENCE.RUПрезидент России молодым ученым и специалистам