Повышение квалификации
«ГЕНЕТИЧЕСКИЕ ПОДХОДЫ В ЛАБОРАТОРНОЙ ДИАГНОСТИКЕ И ПРОФИЛАКТИКЕ ИНФЕКЦИОННЫХ ЗАБОЛЕВАНИЙ»
Видеоролики практических занятий
Тема | Краткое описание |
---|---|
1. Выделение ДНК, основные этапы | Основные этапы выделения ДНК из биологических образцов: получение биологического образца; разрушение клеточной стенки, капсулы, биологических мембран; депротеинизация; очистка, переосаждение, растворение ДНК; проверка качественного и количественного выхода ДНК. Особенности выделения ДНК для полногеномного секвенирования Видеофайл «Выделение ДНК» |
2. ПЦР в режиме реального времени | ПЦР в режиме реального времени, суть метода, особенности постановки, учета и оценки результатов, достоинства, недостатки. Флуоресцентные методы детекции, их разновидности и особенности. Мультиплексная ПЦР в режиме реального времени. Применение ПЦР в режиме реального времени для различных целей Видеофайл «ПЦР в режиме реального времени» |
3. NGS секвенирование: суть, основы применения секвенирования |
NGS секвенирование. Методы секвенирования ДНК первого, второго, третьего поколения. Суть методов, основные этапы, в т.ч. подготовка библиотек, биоинформационный анализ. Основы применения секвенирования |
3.1. Подготовка библиотек | Видеофайл «Подготовка библиотек» |
3.2. Запуск прибора для секвенирования GenoLab M | Видео файл «GenoLab M подготовка к запуску» |
3.3. Запуск прибора для секвенирования Illumina MiSeq | Видеофайл «Illumina MiSeq подготовка к запуску» |
3.4. Биоинформационный анализ данных секвенирования. Основы применения секвенирования | Видеофайл «Анализ данных секвенирования» |
4. Клонирование, методы и инструменты молекулярного клонирования | Клонирование, суть метода, основные этапы. Подбор подходящего для исследования вектора, например, плазмиды. Выделение плазмидной ДНК из бактериальной культуры экспресс-методами. Выделение и очищение целевого фрагмента ДНК: вырезание с помощью эндонуклеаз рестрикции, копирование методом полимеразной цепной реакции (ПЦР) и др. Линелизация плазмиды при помощи эндонуклеаз рестрикции. Визуализация результатов рестрикции методом гель-электрофореза в агарозном геле. Приготовление лигата - сшивка плазмиды и целевой последовательности. Трансформация лигата в реципиентные клетки. Трансформация компетентных клеток. Анализ трансформантов. Применение клонирования для различных целей Видеофайл «Клонирование» |
5. Трансформация компетентных клеток, особенности методологии | Трансформация, суть метода, механизм трансформации. Разновидности трансформации. Компетентные клетки, используемые для трансформации, особенности методологии. Применение трансформации для различных целей (Видеофайл «Клонирование») |