М.Г.Мелоян¹, А.С.Водопьянов¹, Е.А.Воскресенская², А.Л.Трухачёв¹

¹ФКУЗ «Ростовский-на-Дону противочумный институт» Роспотребнадзора, Ростов-на-Дону, Российская Федерация;
²ФБУН «Санкт-Петербургский институт эпидемиологии и микробиологии им. Пастера», Санкт-Петербург, Российская Федерация

Резюме: В работе использованы данные о 146 штаммах Yersinia pseudotuberculosis, среди которых секвенированные нами, а также нуклеотидные последовательности возбудителей псевдотуберкулеза из NCBI. Было разработано программное обеспечение, выявляющее SNP в геномах штаммов Y. pseudotuberculosis. Филогенетический анализ 146 штаммов с известным местом выделения и серотипом проводили с помощью алгоритма MST. При использовании авторского программного обеспечения в геномах было выявлено 26 009 SNP, разделяющих 146 штаммов на 14 SNP-кластеров. Анализ кластеров показал, что их можно обозначить как «российские», «азиатские», «европейские» и «межконтинентальные». «Азиатские» и «европейские» кластеры содержат штаммы, выделенные на территории стан Азии и Европы. В «межконтинентальные» кластеры включают штаммы, выделенные на различных континентах. Кластеры с большинством российских штаммов можно отнести к «азиатским». Ряд штаммов из России обнаружены в «европейских» и «межконтинентальных» кластерах.

Ключевые слова: возбудитель псевдотуберкулеза, Yersinia pseudotuberculosis, SNP, генотипирование

Для цитирования: Мелоян М.Г., Водопьянов А.С., Воскресенская Е.А., Трухачёв А.Л. Генотипирование штаммов возбудителя псевдотуберкулеза, выделенных на территории Российской Федерации, с помощью SNP-маркеров. Бактериология. 2026; 11(1): 85-91.

DOI: 10.20953/2500-1027-2026-1-85-91

Читать полностью PDF-файл