А.А.Ковалевич, А.С.Водопьянов, Е.Д.Василенко, Р.В.Писанов

ФКУЗ «Ростовский-на-Дону ордена Трудового Красного Знамени научно-исследовательский противочумный институт» Роспотребнадзора, Ростов-на-Дону, Российская Федерация

Резюме: Актуальность использования геоинформационных систем в эпидемиологическом надзоре обусловлена их способно- стью обеспечивать оперативный анализ и визуализацию распространения инфекционных заболеваний, обусловлен- ных в т.ч. устойчивыми к антибиотикам штаммами Pseudomonas aeruginosa. Представление данных в геопростран- ственном формате позволяет выявлять закономерности в циркуляции патогенов и повышать точность прогнозирова- ния эпидемиологических рисков.
Цель работы – создание геоинформационной онлайн-системы «ГИС Pseudomonas aeruginosa», содержащей данные о генетических свойствах циркулирующих штаммов, для оценки генетического разнообразия представителей вида P. aeruginosa.
Материалы и методы. В исследовании использованы полногеномные данные 506 штаммов P. aeruginosa, изолиро- ванных на территории России и прилегающих регионов. Анализ полногеномных данных проводился с использованием разработанных авторских инструментов Genomes Validator и Pseudomonas Analyser.
Результаты. Разработана онлайн-система «ГИС Pseudomonas aeruginosa», которая отображает информацию о выбранном штамме: серогруппа, тип жгутикового антигена, мукоидный фенотип, ExoU/ExoS-тип, дата выделения, объ- ект выделения. ГИС расположена на центральном сервере института, что позволяет сотрудникам, имеющим доступ, оперативно получать или пополнять информацию практически из любой точки страны и анализировать эти данные. Анализ данных с использованием разработанной ГИС показал, что на территории России преобладают штаммы с генотипом exoS+ (88%), тогда как более вирулентные exoU+ штаммы встречаются значительно реже (~12%). Наибольшее число exoU+ изолятов зарегистрировано в г. Москве, а также замечен факт их длительной циркуляции.
Заключение. В рамках настоящего исследования впервые разработана геоинформационная система для P. aeruginosa, основанная на интеграции данных о генетических маркерах и молекулярных характеристиках штаммов и позволяю- щая проводить выборку штаммов непосредственно на электронной карте. С помощью «ГИС Pseudomonas aeruginosa» продемонстрированно локальное распространение наиболее вирулентных изолятов exoU+ на территории России, а также региональная специфичность их циркуляции.

Ключевые слова: Pseudomonas aeruginosa, геоинформационная система, серотипы, exoU, exoS, жгутиковый антиген

Для цитирования: Ковалевич А.А., Водопьянов А.С., Василенко Е.Д., Писанов Р.В. Система Pseudomonas aeruginosa. Бактериология. 2026; 11(1): 34-41.

DOI: 10.20953/2500-1027-2026-1-34-41

Читать полностью PDF-файл