А.В.Казанцев¹, М.В.Проскурякова¹, А.А.Буданова¹, А.Н.Микеров^2,3

¹ФКУН «Российский научно-исследовательский противочумный институт «Микроб», Саратов, Российская Федерация;
²Саратовский МНЦ гигиены ФБУН «ФНЦ медико-профилактических технологий управления рисками здоровью населения», Саратов, Российская Федерация;
³ФГБОУ ВО «Саратовский государственный медицинский университет им. В.И.Разумовского» Минздрава России, Саратов, Российская Федерация

Резюме: Цель работы. Идентифицировать О-серогруппы уропатогенных штаммов Escherichia coli (УПЭК), выделенных из мочи пациентов с инфекцией мочевыводящих путей (ИМП) на территории г. Саратова, и определить филогенетические группы и подгруппы, а также факторы патогенности и сиквенс-типы, характерные для различных О-серогрупп.
Материалы и методы. О-серогруппы, факторы патогенности, филогенетические группы и подгруппы для 102 штаммов УПЭК, выделенных из мочи пациентов с ИМП, определяли с использованием методов полимеразной цепной реакции и полногеномного секвенирования. С использованием результатов полногеномного секвенирования установлены сиквенс-типы для 36 штаммов УПЭК.
Результаты. Установлено, что 73 штамма УПЭК принадлежали к 17 различным серогруппам (О1, О2, О6, О7, О8, О15, О18, О25, О29, О45, О53, О75, О76, О83, О101, О109, О117). Наибольшая частота встречаемости определена для серогрупп О25 (32,4%), О2 (8,8%), О1 (5,9%), О6 (4,9%), О101 (3,9%). При этом для серогрупп О25, О2, О1, О6, О101 наиболее характерными были гены fimH, iha, opmT, kpsMT, iron, iuc, irp2, usp, кодирующие факторы патогенности. Гены sfa, hlyA, astA были характерны для штаммов, принадлежащих к серогруппам О2, О6, О25. При определении принадлежности идентифицированных серогрупп штаммов УПЭК к филогенетическим группам и подгруппам было выявлено, что серогруппы О6 и О25 принадлежали к B23, серогруппа О101 – к А1, серогруппа О1 – к А1, В23 и D1, тогда как серогруппа О2 – к B23 и D2. В данной работе также установлены 16 ранее известных сиквенс-типов: ST131, ST10, ST141, ST59, ST69, ST73, ST95, ST127, ST1057, ST117, ST162, ST167, ST416, ST533, ST744, ST12013, а также один неизвестный – ST15134.
Заключение. Штаммы УПЭК, выделенные на территории г. Саратова, в большинстве случаев принадлежали к серогруппам О1, О2, О6, О25 и О101 и характеризовались наличием различных факторов патогенности и принадлежностью к различным филогенетическим группам и подгруппам.

Ключевые слова: уропатогенная Escherichia coli, инфекции мочевыводящих путей, О-серогруппа, факторы патогенности, филогенетическая характеристика, сиквенс-типы

Для цитирования: Казанцев А.В., Проскурякова М.В., Буданова А.А., Микеров А.Н. Характеристика О-серогрупп уропатогенных штаммов Escherichia coli, выделенных из мочи пациентов с инфекциями мочевыводящих путей на территории города Саратова. Бактериология. 2025; 10(4): 68-78.

DOI: 10.20953/2500-1027-2025-4-68-78

Читать полностью PDF-файл