Определение уникальных пептидных маркеров изоформ ботулотоксина для их качественного и количественного определения методом масс-спектрометрии

Н.А.Петухов1, А.К.Сурин1,2, М.М.Рогозин1, К.В.Детушев1, В.В.Фирстова1,3

1ФБУН «Государственный научный центр прикладной микробиологии и биотехнологии» Роспотребнадзора, Оболенск, Московская область, Российская Федерация;
2ГНЦ «Филиал Института биоорганической химии им. академиков М.М.Шемякина и Ю.А.Овчинникова» РАН, Московская область, Пущино, Российская Федерация;
3Пущинский филиал ФГБОУ ВО «Российский биотехнологический университет (РОСБИОТЕХ)», Московская область, Пущино, Российская Федерация

Резюме: Ботулинический токсин – это один из наиболее опасных биологических токсинов, применяемый в медицине, однако несущий потенциальную опасность в качестве агента биологической угрозы. В данном исследовании проведен комплексный in silico анализ аминокислотной последовательности ботулинического токсина разных серотипов с целью идентификации уникальных пептидных маркеров для специфической детекции методами масс-спектрометрии. Проведение биоинформатического анализа и теоретического протеолиза позволило идентифицировать уникальные пептиды, покрывающие различные функциональные домены ботулинических токсинов. Предложенные маркеры демонстрируют полную специфичность к целевым серотипам ботулотоксинов при анализе в базах данных UniProt и NCBI. Отобранные уникальные пептидные маркеры могут быть использованы при проведении анализа биологических образцов, продуктов питания или объектов окружающей среды на наличие ботулотоксинов методом жидкостной хроматографии и масс-спектрометрии в режиме множественного мониторинга реакций или методом времяпролетной масс-спектрометрии с матрично-активированной лазерной десорбцией/ионизацией.

Ключевые слова: ботулотоксин типа А, пептидные маркеры, MALDI-TOF, серотипы, LC-MS/MS, триптический гидролиз, уникальные пептиды, биоинформатический анализ

Для цитирования: Петухов Н.А., Сурин А.К., Рогозин М.М., Детушев К.В., Фирстова В.В. Определение уникальных пептидных маркеров изоформ ботулотоксина для их качественного и количественного определения методом масс-спектрометрии. Бактериология. 2025; 10(4): 36-40.

DOI: 10.20953/2500-1027-2025-4-36-40

Читать полностью PDF-файл