Метагеномный анализ клинических образцов, выделенных во время вспышки микоплазменной пневмонии в России в период с ноября 2023 г. по февраль 2024 г.

В.И.Соломенцев, А.Ю.Лебедева, М.В.Фурсов, А.А.Абаимова, А.А.Кисличкина, А.А.Сизова, Д.В.Волков, Н.К.Фурсова, М.В.Храмов, И.А.Дятлов

ФБУН «Государственный научный центр прикладной микробиологии и биотехнологии» Роспотребнадзора, Оболенск, Московская область, Российская Федерация

Резюме: Инфекции нижних дыхательных путей являются одной из наиболее частых причин смерти в мире. Они могут быть ассоциированы с широким спектром бактериальных, вирусных или грибковых патогенов. Одним из актуальных возбудителей пневмонии является Mycoplasmoides pneumoniae.
Применение наряду с традиционными методами диагностики новых комплексных подходов к анализу клинических образцов, таких как метагеномные исследования, позволяет изучать совокупность патогенов, проводить их генотипирование, устанавливать наличие факторов вирулентности и резистентности.
В данной работе исследованы 464 клинических образца, полученных от пациентов с микоплазменной пневмонией во время вспышки на территории Российской Федерации в период с ноября 2023 г. по февраль 2024 г. Наличие возбудителя M. pneumoniae подтверждено во всех образцах методом полимеразной цепной реакции в реальном времени. Большинство пациентов составляли дети (n = 449), медианный возраст – 12 лет, межквартильный размах – от 10 до 15 лет.
Метагеномный и филогенетический анализы позволили идентифицировать геновариант M. pneumoniae – сиквенстип ST3, относящийся к международному клональному комплексу CC1.
SNP-анализ собранных полных геномов изучаемых образцов M. pneumoniae не выявил мутаций a2063g и/или a2064g в последовательности гена 23S рРНК, наличие которых ассоциировано с устойчивостью патогена к макролидам.
Таким образом, можно предположить, что микоплазмы, содержащиеся в образцах, чувствительны к макролидам.

Ключевые слова: Mycoplasma, микоплазменная пневмония, метагеномное секвенирование

Для цитирования: Соломенцев В.И., Лебедева А.Ю., Фурсов М.В., Абаимова А.А., Кисличкина А.А., Сизова А.А., Волков Д.В., Фурсова Н.К., Храмов М.В., Дятлов И.А. Метагеномный анализ клинических образцов, выделенных во время вспышки микоплазменной пневмонии в России в период с ноября 2023 г. по февраль 2024 г. Бактериология. 2025; 10(4): 16-24.

DOI: 10.20953/2500-1027-2025-4-16-24

Читать полностью PDF-файл