Опыт проведения полногеномного секвенирования штаммов чумного микроба в полевых условиях за пределами Российской Федерации (Монголия)

Г.Х.Базарова, Е.Е.Бжитских, А.А.Киреев, А.А.Оплеухин, А.Ю.Югушев, Е.Н.Рождественский

ФКУЗ «Алтайская противочумная станция» Роспотребнадзора, Горно-Алтайск, Российская Федерация

Резюме: В 2023 г. было проведено испытание мобильной лаборатории для проведения комплексной оценки эпизоотической ситуации на территории Монголии (за пределами Российской Федерации) с проведением генетического анализа выделенных штаммов. Автономность мобильной лаборатории послужила основанием эффективности ее использования при эпизоотологическом обследовании природных очагов чумы, в т.ч. трансграничных, в условиях труднодоступного высокогорья (2300–2800 м над уровнем моря) и отдаленности от лаборатории (560–700 км). Работа мобильной лаборатории (2018, 2019, 2021–2023 гг.) в полевых условиях исключила проблему транспортировки образцов, тем самым повысила сохраноспособность возбудителя от губительного воздействия прямой солнечной радиации и сложного ветрового режима (высушивание). Полученные результаты позволили уточнить и выявить новые эпизоотические участки. Отработанный алгоритм проведения выявления генетических маркеров возбудителя методом полимеразной цепной реакции и дальнейшего выполнения бактериологического анализа положительных проб с целью выделения культуры возбудителя позволил сократить объем и сроки бактериологических исследований. Для проведения комплексного анализа ситуации в 2023 г. выделенные штаммы (20) основного подвида были исследованы методом полногеномного секвенирования, тем самым была продемонстрирована циркуляция генетически отличающихся штаммов чумы основного подвида в пределах одного участка.

Ключевые слова: Yersinia pestis, мобильная лаборатория, Сайлюгемский природный очаг чумы, секвенирование, генетическое типирование

Для цитирования: Базарова Г.Х., Бжитских Е.Е., Киреев А.А., Оплеухин А.А., Югушев А.Ю., Рождественский Е.Н. Опыт проведения полногеномного секвенирования штаммов чумного микроба в полевых условиях за пределами Российской Федерации (Монголия). Бактериология. 2025; 10(3): 33-36.

DOI: 10.20953/2500-1027-2025-3-33-36

Читать полностью PDF-файл