А.М.Горох, А.С.Водопьянов, А.А.Герасименко, Р.В.Писанов

ФКУЗ «Ростовский-на-Дону противочумный институт» Роспотребнадзора, Ростов-на-Дону, Российская Федерация

Резюме: В работе изучено генетическое разнообразие штаммов Salmonella enterica, выделенных в Донецкой Народной Республике в 2022–2023 гг. из клинического материала, продуктов питания и объектов окружающей среды. Для изучения штаммов было проведено полногеномное секвенирование исследуемых культур с применением биоинформационного анализа авторскими и сторонними программами. В ходе работы выделено и изучено 29 штаммов S. enterica, отличающихся по серотипам, INDEL-, SNP-, плазмидным профилям, наличию/отсутствию генов патогенности. Проведен SNP-анализ с построением филогенетического дерева изученных изолятов. Это, в свою очередь, позволило оценить циркуляцию штаммов различных серотипов S. enterica.

Ключевые слова: Salmonella enterica, генотипирование, гены вирулентности, плазмидный состав, INDEL, SNP-анализ, минимальное связующее дерево

Для цитирования: Горох А.М., Водопьянов А.С., Герасименко А.А., Писанов Р.В. Молекулярно-генетический анализ штаммов Salmonella enterica, выделенных в Донецкой Народной Республике в 2022–2023 гг. Бактериология. 2025; 10(2): 60-66.

DOI: 10.20953/2500-1027-2025-2-60-66

Читать полностью PDF-файл