С.О.Водопьянов, О.С.Чемисова, А.С.Водопьянов, Р.В.Писанов, М.М.Сагакянц, О.А.Цырулина

ФКУЗ «Ростовский-на-Дону противочумный институт» Роспотребнадзора, Ростов-на-Дону, Российская Федерация

Резюме: Для выявления интегративных конъюгативных элементов (ICE) Vibrio parahaemolyticus сконструированы праймеры, фланкирующие место интеграции ICE в 5’ конец гена pfrC3. В случае интактного гена pfrC3 при проведении полимеразной цепной реакции формируется фрагмент размером 478 п.о., в случае вставки ICE продукт амплификации отсутствует. При анализе коллекции из 14 культур V. parahaemolyticus обнаружено отсутствие ампликона при анализе ДНК из штамма 19632. Проведенный полногеномный сиквенс этого штамма и последующий биоинформационный анализ показал, что у него между 5’ и 3’ концами гена pfrC3 встроен ICE-элемент размером 71 684 п.о., обозначенный нами как ICEVpaRus и кодирующий 91 ген. В составе идентифицированного ICEVpaRus и двух ранее описанных ICE элементов V. parahaemolyticus ICEVpaCan1 и IECVpaTF2 не идентифицирован ни один из генов антибиотикорезистентности. Анализ идентифицированных генов показал высокую степень уникальности белков для каждого ICE, а также присутствие значительного числа гипотетических протеинов, т.е. белков с не установленной на данный момент функцией.

Ключевые слова: Vibrio parahaemolyticus, интегративные конъюгативные элементы, ICE, праймеры, ген pfrC3

Для цитирования: Водопьянов С.О., Чемисова О.С., Водопьянов А.С., Писанов Р.В., Сагакянц М.М., Цырулина О.А. ICEVpaRus – новый ICE- элемент Vibrio parahaemolyticus. Бактериология. 2023; 8(4): 42-46.

DOI: 10.20953/2500-1027-2023-4-42-46

Читать полностью PDF-файл