А.С.Вагайская, А.С.Трунякова, С.В.Дентовская

ФБУН «Государственный научный центр прикладной микробиологии и биотехнологии» Роспотребнадзора, Оболенск, Российская Федерация

Резюме: Для внутривидовой дифференциации штаммов Yersinia pestis с разной эффективностью использовали множество методов. В настоящее время молекулярно-генетические подходы все чаще заменяют традиционные методы, основанные на оценке фенотипических свойств возбудителя чумы. В данном обзоре особое внимание уделено методам типирования чумного микроба, отвечающим требованиям популяционной генетики, филогеографии и молекулярной эпидемиологии. Описанные подходы оцениваются с точки зрения стоимости, сложности выполнения, межлабораторной воспроизводимости результатов, дискриминационной способности, полезности для решения различных вопросов исследования и текущей применимости вследствие появления метода полногеномного секвенирования.

Ключевые слова: Yersinia pestis, внутривидовая дифференциация, RFLP, IS-элементы, DFR, LCB, MLVA, CRISPR, SNP, полногеномное секвенирование

Для цитирования: Вагайская А.С., Трунякова А.С., Дентовская С.В. Внутривидовая дифференциация Yersinia pestis: от фенотипа к полногеномному секвенированию. Бактериология. 2019; 4(2): 42-54.

DOI: 10.20953/2500-1027-2019-2-42-54

Читать полностью PDF-файл