Н.Е.Гаевская, М.П.Погожова, А.С.Водопьянов, Р.В.Писанов, Л.В.Романова, А.О.Аноприенко, С.Н.Головин, А.В.Тюрина

ФКУЗ «Ростовский-на-Дону противочумный институт» Роспотребнадзора, Ростов-на-Дону, Российская Федерация

Резюме: На сегодняшний день обнаружено множество генов интеграз, антибиотикорезистентности и токсинов, которые могут быть встроены в фаговый геном. Весьма актуальным является изучение выделенных фагов на предмет наличия в них этих генов. Наиболее информативным методом для выявления генетических детерминант факторов патогенности и интеграз является полногеномное секвенирование. Целью нашего исследования было изучить не только биологию холерного бактериофага Vibrio phage Rostov 7, но и провести полногеномное секвенирование с дальнейшей оценкой перспектив его практического использования. Наличие или отсутствие генетических детерминант факторов резистентности, токсинов и интеграз проверяли при помощи созданной нами базы данных и разработанного программного обеспечения под названием PhageAnalyzer. При помощи электронно-микроскопического исследования установлена морфология корпускул холерного бактериофага Rostov 7, а также подтверждена его специфичность. На газоне индикаторной культуры бактериофаг Rostov 7 образует прозрачные негативные колонии диаметром 1,0–1,5 мм. Анализ нуклеотидных последовательностей показал, что размер его генома составляет 45903 п.н. с общим количеством ORF 35, также обнаружены гены, характерные для хвостатых фагов. Установлено, что бактериофаг Rostov 7 имеет обособленное положение и является уникальным. В структуре генома найдены две интегразы (YP_009043902.1 и YP_009043892.1), поэтому использование фага в профилактических или лечебных препаратах исключено, так как он является умеренным. Генетических детерминант факторов антибиотикорезистентности и токсинов не обнаружено. В настоящее время бактериофаг активно используется в экспериментальной деятельности лаборатории и для конструирования диагностических препаратов. Полная геномная последовательность Vibrio phage Rostov 7 депонирована в международной базе GenBank (NCBI) под номером MK575466.1.

Ключевые слова: Vibrio phage Rostov 7, Myoviridae, холера, секвенирование, бактериофаг

Для цитирования: Гаевская Н.Е., Погожова М.П., Водопьянов А.С., Писанов Р.В., Романова Л.В., Аноприенко А.О., Головин С.Н., Тюрина А.В. Биологическая и генетическая характеристика холерного бактериофага Rostov 7. Бактериология. 2019; 4(2): 27-30.

DOI: 10.20953/2500-1027- 2019-2-27-30

Читать полностью PDF-файл