Изучение геномной организации Chlamydia psittaci с применением алгоритмов метагеномных исследований

А.Г.Богун1, В.А.Федорова2, А.А.Кисличкина1, А.А.Сизова1, И.А.Дятлов1

1ФБУН «Государственный научный центр прикладной микробиологии и биотехнологии» Роспотребнадзора, Оболенск, Московская область, Российская Федерация
2ФГБУН «Федеральный исследовательский центр вирусологии и микробиологии», филиал в Саратове, Саратов, Российская Федерация

Резюме: В работе приведено описание биоинформационных методов исследований, использованных для анализа геномов Chlamydia psittaci. Данный микроорганизм является облигатным внутриклеточным паразитом, культивирование которого возможно только с использованием живых эукариотических клеток. Особенность препаратов ДНК, получаемых из подобных образцов, заключается в значительном содержании нуклеиновых кислот из эукариотических клеток. В работе изучена эффективность методов биоинформационного анализа для осуществления сборки геномных последовательностей Chlamydia psittaci.

Ключевые слова: геномное секвенирование, биоинформационный анализ, внутриклеточные паразиты

Для цитирования: Богун А.Г., Федорова В.А., Кисличкина А.А., Сизова А.А., Дятлов И.А. Изучение геномной организации Chlamydia psittaci с применением алгоритмов метагеномных исследований. Бактериология. 2018; 3(3): 7-13.

DOI: 10.20953/2500-1027-2018-3-7-13

Читать полностью PDF-файл