А.Н.Куличенко¹, А.С.Волынкина¹, Я.В.Лисицкая¹, Е.С.Котенев¹, И.В.Кузнецова¹, А.Т.Подколзин², Е.В.Зайцева², Н.В.Паркина², В.Г.Оробей³

¹ФКУЗ «Ставропольский противочумный институт Роспотребнадзора, Ставрополь, Российская Федерация
²ФБУН «Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии» Роспотребнадзора, Москва, Российская Федерация
³Территориальный отдел Управления Роспотребнадзора по г. Сочи, Сочи, Российская Федерация

Резюме: С целью определения фоновых генотипов актуальных для территории г.-к. Сочи инфекционных болезней проведено исследование и генотипирование изолятов нуклеиновых кислот (НК) возбудителей острых кишечных инфекций – 295 проб и природно-очаговых инфекций (ПОИ) – 30 пулов иксодовых клещей и 290 проб от грызунов, выявленных в регионе в 2015 г. Использованы методы MLST-анализа и прямого секвенирования. Установлено, что наибольший удельный вес в структуре заболеваемости ОКИ имели ротавирусы группы А генотипов G9[P]8 и G4[P]8 и норовирусы II генотипа, варианты: GII.P4 New_Orlean_2009-GII.4 Sydney_2012 и GII.Pe –GII.4 Sydney_2012. Выявлены и типированы изоляты НК возбудителей ПОИ: на территории Лазаревского района г.-к. Сочи – Rickettsia helvetica, в Хостинском районе – боррелии вида Borrelia lusitaniae и хантавирус «Адлер» подгруппы II, на территории Адлерского района – боррелии B. garinii и хантавирус «Добрава/Белград» генотипа «Сочи». Проведен анализ эпидемического потенциала идентифицированных генотипов.

Ключевые слова: генотипирование, острые кишечные инфекции, природно-очаговые инфекции

Для цитирования: Куличенко А.Н., Волынкина А.С., Лисицкая Я.В., Котенев Е.С., Кузнецова И.В., Подколзин А.Т., Зайцева Е.В., Паркина Н.В., Оробей В.Г. Генетическое профилирование актуальных для региона г.-к. Сочи возбудителей природно-очаговых и кишечных инфекций. Бактериология. 2016; 1(1): 16-21.

DOI: 10.20953/2500-1027-2016-1-16-21

Читать полностью PDF-файл