Писаренко С.В., Ковалев Д.А., Хачатурова А.А., Волынкина А.С., Русанова Д.В., Куличенко А.Н.

ФКУЗ «Ставропольский противочумный институт» Роспотребнадзора, Ставрополь, Российская Федерация

Резюме: В рамках исследования получены полногеномные нуклеотидные последовательности 11 штаммов возбудителя бруцеллеза, выделенных на территории Российской Федерации. Предложена модифицированная методика SNP-анализа полных геномов патогенных микроорганизмов, включающая анализ кодирующих и некодирующих участков генома, что позволяет повысить достоверность полученных результатов, а также выявить ранее не описанные полиморфизмы. Представлены результаты оценки глобального филогеографического разнообразия штаммов Brucella (B.) melitensis. Впервые определены наборы единичных нуклеотидных замен, позволяющих дифференцировать разные генотипы возбудителя бруцеллеза. Установлено, что штаммы B. melitensis, циркулирующие на юге России, принадлежат к ранее не описанному генотипу. Сформулировано предположение об общности происхождения штаммов возбудителя бруцеллеза, циркулирующих на юге России и в регионах Центральной Азии.

Ключевые слова: Brucella, филогеография, геном, SNP

Для цитирования: Писаренко С.В., Ковалев Д.А., Хачатурова А.А., Волынкина А.С., Русанова Д.В., Куличенко А.Н. Филогеография штаммов Brucella melitensis на основе анализа SNP полных геномов. Бактериология. 2016; 1(1): 73-79.

DOI: 10.20953/2500-1027-2016-1-73-79

Читать полностью PDF-файл